Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms