Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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