Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shmt2Q9CZN7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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