Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Shisa9Q9CZN4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms