Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Cnih4Q9CX13 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Cnih4Q9CX13 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Cnih4Q9CX13 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Cnih4Q9CX13 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Cnih4Q9CX13 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih4Q9CX13 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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