Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms