Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms