Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Fcf1Q9CTH6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Fcf1Q9CTH6 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Fcf1Q9CTH6 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Fcf1Q9CTH6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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