Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl17Q9CPR4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms