Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms