Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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