Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms