Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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