Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Mroh2a-202ENSMUST00000113130 7491 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Nalcn-201ENSMUST00000000201 7122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Prdm2-201ENSMUST00000105778 7304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Eya3-202ENSMUST00000079157 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SptssbQ925E8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms