Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Letmd1Q924L1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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Letmd1Q924L1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Letmd1Q924L1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Letmd1Q924L1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Letmd1Q924L1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Letmd1Q924L1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Letmd1Q924L1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms