Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Sf3b5Q923D4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sf3b5Q923D4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sf3b5Q923D4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sf3b5Q923D4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms