Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp3Q91W36 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp3Q91W36 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp3Q91W36 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Usp3Q91W36 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Usp3Q91W36 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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