Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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Dnajc28Q8VCE1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Dnajc28Q8VCE1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Dnajc28Q8VCE1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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