Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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