Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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