Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms