Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms