Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AL672010.1-201ENSMUST00000215182 1246 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AC124484.1-201ENSMUST00000223212 652 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AC107711.6-201ENSMUST00000228455 1088 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm43593-201ENSMUST00000198605 1346 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Tmem14a-201ENSMUST00000027064 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm43785-201ENSMUST00000201036 1345 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Nlrp9b-202ENSMUST00000117909 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms