Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ss18l1Q8BW22 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms