Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.8 ms