Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms