Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Rbfox3Q8BIF2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Rbfox3Q8BIF2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Rbfox3Q8BIF2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rbfox3Q8BIF2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rbfox3Q8BIF2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rbfox3Q8BIF2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rbfox3Q8BIF2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rbfox3Q8BIF2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rbfox3Q8BIF2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rbfox3Q8BIF2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rbfox3Q8BIF2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rbfox3Q8BIF2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rbfox3Q8BIF2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rbfox3Q8BIF2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rbfox3Q8BIF2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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