Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed4Q80WQ9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Zbed4Q80WQ9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Zbed4Q80WQ9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Zbed4Q80WQ9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Zbed4Q80WQ9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Zbed4Q80WQ9 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Zbed4Q80WQ9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Zbed4Q80WQ9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Zbed4Q80WQ9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Zbed4Q80WQ9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Zbed4Q80WQ9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Zbed4Q80WQ9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Zbed4Q80WQ9 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed4Q80WQ9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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