Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcsk9Q80W65 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms