Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccp110Q7TSH4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms