Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms