Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms