Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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NipblQ6KCD5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
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