Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fbxo27Q6DIA9 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms