Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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