Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms