Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc3Q64519 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sdc3Q64519 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sdc3Q64519 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sdc3Q64519 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Sdc3Q64519 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Sdc3Q64519 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Sdc3Q64519 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Sdc3Q64519 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Sdc3Q64519 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Sdc3Q64519 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sdc3Q64519 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sdc3Q64519 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sdc3Q64519 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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