Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PtprdQ64487 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PtprdQ64487 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PtprdQ64487 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PtprdQ64487 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PtprdQ64487 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtprdQ64487 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtprdQ64487 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtprdQ64487 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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