Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms