Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Prdm1Q60636 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm1Q60636 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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