Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tsr1Q5SWD9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tsr1Q5SWD9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsr1Q5SWD9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tsr1Q5SWD9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tsr1Q5SWD9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms