Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms