Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms