Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34b4Q3V0X2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms