Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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