Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ttc9Q3V038 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ttc9Q3V038 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ttc9Q3V038 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc9Q3V038 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc9Q3V038 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc9Q3V038 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc9Q3V038 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ttc9Q3V038 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ttc9Q3V038 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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