Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm29609Q3UU56 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm29609Q3UU56 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm29609Q3UU56 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm29609Q3UU56 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm29609Q3UU56 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm29609Q3UU56 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm29609Q3UU56 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm29609Q3UU56 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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