Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Znf48Q3US17 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Znf48Q3US17 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Znf48Q3US17 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Znf48Q3US17 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Znf48Q3US17 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Znf48Q3US17 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Znf48Q3US17 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Znf48Q3US17 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Znf48Q3US17 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Znf48Q3US17 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Znf48Q3US17 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Znf48Q3US17 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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