Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc4Q3UP44 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms