Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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